D. Yu. Ryazantsev, E. M. Chudinova, L. Yu. Kokaeva, S. N. Elansky, P. N. Balabko, G. L. Belova, S. K. Zavriev
Ang phytopathogenic fungus na Colletotrichum coccodes ay nagdudulot ng mga mapanganib na sakit sa patatas at kamatis na kilala bilang anthracnose at tuber black spot. Sa pamamagitan ng mga katangian ng morphological, madalas silang mahirap makilala mula sa mga sakit na dulot ng iba pang mga mikroorganismo; sa mga berdeng prutas na kamatis, ang sakit ay maaaring walang sintomas, nagpapakita lamang sa mga hinog na pulang prutas. Para sa mabilis at tumpak na pagsusuri ng pathogen, inaalok ang isang real-time na PCR test system. Upang makabuo ng isang sistema ng pagsubok, natutukoy ang pagkakasunud-sunod ng nucleotide ng glycerol triphosphate dehydrogenase gene na 45 C. mga coccode na pinaghiwalay mula sa mga tubo ng patatas sa iba't ibang mga rehiyon ng Russia
Batay sa mga resulta na nakuha at ang pagtatasa ng magkatulad na pagkakasunud-sunod ng iba pang mga species na magagamit sa database ng GenBank, ang mga primerong partikular sa species at pagsisiyasat para sa C. coccodes ay dinisenyo. Upang masubukan ang pagiging tiyak ng nilikha na sistema ng pagsubok, ang PCR ay isinasagawa na may DNA na ihiwalay mula sa purong kultura ng 15 iba't ibang mga species ng parasitiko at saprotrophic fungi na nauugnay sa mga halaman ng kamatis at patatas (Fusarium oxysporum, F. verticillium, Phomopsis phaseoli, Alternaria alternata, Helminthosporium solani, Colletotrichum coccodes Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Helminthosporium solani, Phomopsis phaseoli, Neonectria radicicola, Rhizoctonia solani, Penicillium sp., Cladosporium fulvum, C. cladosporioides). Ang pagkakaroon ng Colletotrichum coccodes DNA ay natutukoy sa isang threshold cycle ng 20-27, habang ang iba pang mga species ay napansin pagkatapos ng 40 cycle o hindi napansin. Ginagawang posible ng test system na mapagkakatiwalaan na makita ang mga konsentrasyon ng C. coccodes ng DNA na higit sa 0.01 ng / mm3 sa pinag-aralan na pinaghalong PCR. Gamit ang nabuong sistema ng pagsubok, ang pagkakaroon ng C. coccodes sa mga dahon ng kamatis na may mga sintomas ng mga fungal disease at sa mga patatas na tubers na walang panlabas na mga sintomas ng sakit ay naimbestigahan. Ang mga dahon na may mga sintomas ng impeksyong fungal ay nakolekta mula sa dalawang magkakaibang larangan sa rehiyon ng Krasnodar, mga tubers - mula sa mga bukirin sa mga rehiyon ng Kostroma, Moscow, Kaluga, Nizhny Novgorod. Isang dahon ng kamatis na naglalaman ng C. coccodes DNA ang natagpuan sa Teritoryo ng Krasnodar; isang makabuluhang pagkakaroon ng DNA ng pathogen na ito ang napansin sa 5 mga sample ng tubers na lumago sa mga rehiyon ng Kostroma, Moscow, Kaluga.
Pagpapakilala
Ang mga kabute ng genus na Colletotrichum ay mapanganib na mga phytopathogens na nakakaapekto sa mga siryal, gulay, halaman, perennial na prutas at mga halaman ng berry. Isa sa mga lahat ng nasa lahat ng pook species ng genus na ito, Colletotrichum coccodes (Wallr).
Ang Hughes, ay ang causative agent ng antracnose at itim na spot ng patatas at kamatis, at sanhi ng mga sakit ng maraming iba pang mga halaman ng pamilya Solanaceae, kasama na. mga damo (Dillard, 1992). Ang C. coccodes ay nahahawa sa lahat ng mga bahagi sa ilalim ng lupa ng halaman, mga base base, dahon, at prutas (Andrivon et al., 1998; Johnson, 1994). Sa alisan ng balat ng mga nahawaang tubers ng patatas, ang pag-unlad ng mga grey spot na may hindi malinaw na binibigkas na mga gilid ay sinusunod, kung saan malinaw na nakikita ang mga itim na tuldok ng sporulation at microsclerotia. Sa panahon ng pag-iimbak, ang mga ulser na may lamog na nilalaman ay maaaring mabuo sa pulp ng tubers, ibig sabihin ang sakit ay pumapasok sa anthracnose phase, kung saan, gayunpaman, ay napakabihirang.
Sa parehong oras, ang mga sintomas ng antracnose (mga ulser sa balat na may maliit na mga itim na tuldok) ay tipikal ng mga prutas na kamatis. Sa mga dahon, ang mga sintomas ng C. coccodes ay lilitaw bilang mga madilim na kayumanggi spot, karaniwang may hangganan ng dilaw na tisyu (Johnson, 1994).
Ang pag-unlad ng itim na lugar sa tubers ay sumisira sa kanilang hitsura, na kung saan ay lalo na binibigkas kapag nagbebenta ng mga hugasan na red-peel na patatas. Ang pagtuklap ng balat ay humahantong sa labis na pagsingaw at nadagdagan ang pagkawala ng imbakan (Gutom at McIntyre, 1979). Ang pinsala sa iba pang mga organo ng halaman ay humahantong sa pagkalugi ng ani, na nabanggit sa parehong bukas at saradong lupa (Johnson, 1994; Tsror et al., 1999). Ang mga sakit na sanhi ng C. coccodes ay karaniwan sa halos lahat ng mga rehiyon na gumagawa ng patatas sa buong mundo, kasama na ang Russia (Leesa, Hilton, 2003; Belov et al, 2018). Ang pagkontrol sa mga sakit na ito ay mahirap dahil sa hindi sapat na bisa ng mga mayroon nang fungicide laban sa C. coccodes at ang kakulangan ng lumalaban na mga barayti (Basahin, Itago, 1995).
Ang C. coccodes inoculum ay maaaring magpatuloy sa mga tubers ng binhi (Basahin at Itago, 1988; Johnson et al., 1997), mga binhi ng kamatis (Ben-Daniel et al., 2010), mabuhay nang mahabang panahon sa lupa, sa mga labi ng halaman (Dillard, 1990 ; Dillard, Cobb, 1993) at sa mga damo (Raid, Pennypacker, 1987). Ang mga gawa ng isang bilang ng mga may-akda (Basahin, Itago, 1988; Barkdoll, Davis, 1992; Johnson et al., 1997; Dillard, Cobb, 1993) ay ipinapakita na ang pag-unlad ng sakit sa patatas at kamatis ay higit sa lahat nakasalalay sa pagkakaroon ng inoculum sa binhi at lupa Samakatuwid, upang i-minimize ang mga pagkalugi mula sa sakit, kinakailangan upang masuri (kabilang ang dami) ang mga propagula ng halamang-singaw sa materyal na binhi, sa lupa, sa mga tubong patatas ng binhi at mga binhi ng kamatis na inilatag para sa pag-iimbak. Ang mga diagnostic ng morphological sa lupa at materyal ng halaman ay maaaring isagawa lamang sa pagkakaroon ng microsclerotia, na, gayunpaman, ay matatagpuan din sa iba pang mga uri ng fungi.
Ang mga sintomas sa tubers ay halos kapareho ng scab ng pilak na sanhi ng fungus Helminthosporium solani. Ang paghihiwalay ng mga coccode ng Colletotrichum at Helminthosporium solani sa isang purong kultura ay medyo mahirap at tumatagal ng mahabang panahon dahil sa mabagal na paglaki ng isang medium na nakapagpalusog. Upang mabilis na makilala ang mga coccode ng Colletotrichum, kinakailangang gumamit ng mga instrumental na diagnostic na pamamaraan. Ang pinaka-maginhawang pamamaraan ay ang reaksyon ng polymerase chain (PCR) at ang pagbabago nito - real-time PCR. Sa kasalukuyan, ang isang sistema ng pagsubok na binuo ng mga mananaliksik ng Britain (Cullen et al., 2002) para sa rehiyon ng ITS1 ng rDNA ay ginagamit sa Europa at Estados Unidos. Ang paggamit nito ay nagpakita ng magagandang resulta sa pagsusuri ng mga isolate ng Russia (Belov et al, 2018). Gayunpaman, ang C. coccodes ay lubos na nag-iiba at ang pagkakita nito mula sa iisang pagkakasunud-sunod ng DNA ay maaaring humantong sa maling negatibong resulta. Para sa isang mas maaasahang pagsusuri, kinakailangan upang pag-aralan ang ilang mga pagkakasunud-sunod ng DNA na tukoy sa species, na may kaugnayan sa kung saan nakabuo kami ng isang orihinal na sistema ng pagsubok na nagpapahintulot sa amin na makilala ang mga C. coccode ng pagkakasunud-sunod ng glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene.
Mga materyales at pamamaraan
Upang masuri ang pagiging epektibo at pagiging tiyak ng mga nilikha na mga sistema ng pagsubok, gumamit kami ng mga purong kultura ng 15 species ng fungi, na ihiwalay ng mga may-akda mula sa mga apektadong sample ng dahon at prutas ng kamatis, mga patatas na tubers (Talahanayan 1). Para sa paghihiwalay, kumuha kami ng mga organo ng halaman na may mga sintomas ng impeksyong fungal, hindi hihigit sa isang organ bawat bush.
Ang isang hiwa ng isang tuber na may isang alisan ng balat, isang hiwa ng isang prutas na kamatis, at isang apektadong dahon ay inilagay sa ilalim ng isang binocular microscope, pagkatapos na ang mycelium, spores, o isang piraso ng tisyu ay inilipat sa isang agar medium (wort agar) sa isang pinggan ng Petri na may isang hinigpit na karayom. Ang mga isolates ay nakaimbak sa agar slant sa mga test tubes sa 4 ° C.
Ang mga sample ng dahon ng kamatis na may mga sintomas ng mga sakit na fungal na inilaan para sa pagtatasa kaagad pagkatapos ng koleksyon (sa patlang) ay inilagay sa 70% etil alkohol kung saan sila ay nakaimbak hanggang sa ihiwalay ng DNA. Ang mga patatas na tubers ay naihatid sa laboratoryo, binabalot (2 × 1 cm na piraso) mula sa kanila, at na-freeze sa –20 ° C. Nakaimbak na frozen hanggang sa ihiwalay ang DNA.
Ang mga purong kultura ng fungi para sa paghihiwalay ng DNA ay lumago sa likidong gisantes ng gisantes. Ang mycelium ng halamang-singaw ay tinanggal mula sa likidong likido, pinatuyong sa papel ng pansala, na-freeze sa likidong nitrogen, homogenized, incubated sa buffer ng CTAB, pinadalisay ng chloroform, pinapabilis ng pinaghalong isopropanol at 0.5 M potassium acetate, hinugasan ng dalawang beses sa 2% na alkohol. Ang nagresultang DNA ay natunaw sa deionized na tubig at naimbak sa –70 ° (Kutuzova et al., 20). Sinusukat ang konsentrasyon ng DNA gamit ang isang HS DNA quantification kit para sa doble na straced DNA sa Qubit 2017 (Qiagen, Germany). Ang mga naka-alkohol at naka-freeze na sample ay triturated sa likidong nitrogen, pagkatapos ang pagkuha ng DNA ay isinasagawa sa parehong paraan tulad ng inilarawan sa itaas (para sa mycelium ng purong mga fungal na kultura).
Talahanayan 1. Pinagmulan ng mga ginamit na fungi strain
Pangalan ng kabute | Halaman, organ | Lugar ng pagpili |
---|---|---|
Colletotrichum coccodes 1, C. coccodes 2, C. coccodes 3, Ilyonectria crassa, Rhizoctonia solani | patatas na tuber | Ang rehiyon ng Kostroma, mga tubers ng patatas ng unang henerasyon sa bukid, kultivar na Red Scarlett |
Colletotrichum coccodes 4 | dahon ng patatas | Rep. Mari El, Yoshkar-Ola |
Helminthosporium solani | patatas na tuber | Rehiyon ng Magadan, pos. Tent, tubo ng patatas |
Cladosporium fulvum | dahon ng kamatis | Rehiyon ng Moscow, kamatis na may malalaking prutas |
Alternaria tomatophila | prutas na kamatis | isinumite ng tauhan ng laboratoryo ng mycology at fitopathology ng All-Russian Research Institute ng Proteksyon ng Halaman |
Fusarium verticillium, Phomopsisphaseoli, Alternaria alternata, Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Cladosporium cladosporioides, Acrodontium luzulae, Penicillium sp. | prutas na kamatis | Teritoryo ng Krasnodar, distrito ng Krymsky, grade Cream |
Fusarium oxysporum | ugat ng trigo | Moscow region |
Ginawa ang PCR sa isang DTprime amplifier (DNA-Technology). Para sa PCR, mga orihinal na panimulang aklat at isang pagsisiyasat para sa partikular na species ng rehiyon ng glycerol triphosphate dehydrogenase gene ay ginamit: paunang primer Coc70gdf –TCATGATATCATTTCTCTCACGGCA, reverse primer Coc280gdr - TACTTGAGCATGTAGGCCTGGGT1). Ang mga primer ay nagpapalakas ng isang rehiyon ng 213 bp.
Ang reaksyon ay tumagal ng 50 ng ng kabuuang DNA (kapag pinag-aaralan ang mga dahon at tubers) at 10 ng (kapag pinag-aaralan ang DNA ng purong mga fungal na kultura). Ang pinaghalong reaksyon (35 μl) ay pinaghiwalay ng isang paraffin layer sa dalawang bahagi: ang mas mababang isa (20 μl) ay naglalaman ng 2 μl ng 10 × reaksyon ng buffer (750 mM Tris-HCl, pH 8.8; 200 mM (NH4) 2SO4; 25 mM MgCl2; 0.1% T pagitan 20), 0.5 mM ng bawat deoxynucleotide triphosphate, 7 pmol ng bawat panimulang aklat, at 4 pmol ng isang hydrolyzable fluorescent probe; ang nasa itaas ay naglalaman ng 1 μl ng 10 × PCR buffer at 1 U ng Taq polymerase.
Ang paghihiwalay ng halo na may paraffin ay nagbibigay-daan sa mga tubo na maiimbak ng mahabang panahon sa temperatura na 5 ° C at upang magbigay ng isang mainit na pagsisimula para sa PCR pagkatapos ng pag-init ng mga ito ng 10 minuto sa isang temperatura sa itaas 80 ° C. Ginawa ang PCR alinsunod sa sumusunod na programa: 94.0 ° C - 90 s (1 cycle); 94.0 ° C - 30 s; 64.0 ° C - 15 s (5 cycle); 94.0 ° C - 10 s; 64.0 ° C - 15 s (45 cycle); 10.0 ° C - imbakan.
resulta at diskusyon
Ang mga pagkakasunud-sunod ng glycerol trifosfat dehydrogenase ay natutukoy sa 45 na mga pagkakasama na nakahiwalay sa mga dahon, tangkay, tubo ng patatas at prutas ng kamatis (Kutuzova, 2018) sa iba't ibang mga rehiyon ng Russia. Ang mga naimbestigahang pagkakasunud-sunod ng lahat ng mga pinagmanahan ay nahahati sa 2 mga pangkat na naiiba sa dalawang mga nucleotide. Ang mga pagkakasunud-sunod ng nucleotide ng mga kinatawan ng parehong mga grupo sa ilalim ng bilang na KY496634 at KY496635 ay na-deposito sa GenBank.
Ang mga primer coc70gdf, coc280gdr at ang cocgdz probe na dinisenyo ayon sa kanilang batayan ay nasuri gamit ang BLAST program (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) sa lahat ng mga pagkakasunud-sunod ng glycerol triphosphate dehydrogenase na gene ng mga species ng genus na Colletotrichum at iba pang mga organismo na magagamit sa database ng GenBank.
Walang mga rehiyon ng DNA ng iba pang mga organismo na lubos na homologous sa mga primer at probe na natagpuan.
Ang pagkasensitibo ng sistema ng pagsubok ay nasuri gamit ang mga sampol na may iba't ibang konsentrasyon ng C. coccodes DNA, DNA mula sa isang dahon ng patatas na nahawahan ng antracnose (nakolekta noong 2017 sa Mari El, iba't ibang Red Scarlett), at alisan ng balat ng tubers na apektado ng itim na lugar (nakolekta sa rehiyon ng Kostroma, iba't ibang Red Scarlett, Talahanayan 2). Upang kumpirmahin ang pagkakaroon ng DNA sa mga tubers at dahon ng patatas, ang mga C. coccodes na strain ay ihiwalay mula sa kanila sa mga dalisay na kultura.
Ang mga resulta ng pagsusuri ng pagiging sensitibo ng sistema ng pagsubok ay nagpapakita na maaari itong magamit upang matagumpay na masuri ang pagkakaroon ng C. coccodes DNA sa isang sample kung ang kabuuang nilalaman nito sa pinaghalong PCR ay higit sa 0.05 ng. Ito ay sapat na para sa pagtuklas, dahil ang isang sclerotia ay naglalaman ng, sa average, 0.131 ng, at isang spore ay naglalaman ng tungkol sa 0.04 ng ng DNA (Cullen et al., 2002). Ang sistema ng pagsubok na binuo ng pangkat ng British (Cullen et al., 2002) ay nagpakita ng katulad na pagkasensitibo (threshold cycle 34 sa 0.05 ng DNA at 37 sa 0.005 ng).
Ang pagtatasa ng mga natural na sample na naglalaman ng C. coccodes sa lahat ng mga kaso ay ginawang posible upang mapagkakatiwalaan na ihayag ang pagkakaroon nito sa sample (Talahanayan 2). Ang iminungkahing pamamaraan para sa paghihiwalay ng DNA ay naaangkop din para sa pagtatasa ng mga natural na sample ng halaman.
Talahanayan 2. Pagtukoy ng pagiging sensitibo ng ipinanukalang sistema ng pagsubok para sa pagkilala sa mga coccode ng Colletotrichum para sa real-time PCR
Образец | Ang dami ng DNA sa sample *, ng | Cycle ng threshold | C. pagtuklas ng coccodes |
---|---|---|---|
Mycelium Colletotrichum coccodes | 50 | 21.3 | + |
5 | 25.7 | + | |
0.5 | 29,7 | + | |
0.05 | 33.5 | + | |
0.005 | 40 | - | |
0.0005 | 42.8 | - | |
0.00005 | - | ||
Peel peel 1 | 50 | 32 | + |
Peel peel 2 | 50 | 30 | + |
Peel peel 3 | 50 | 31.5 | + |
Dahon ng patatas | 50 | 29.5 | + |
Tandaan * Sa isang halo ng mga produkto ng PCR.
Ang pagiging tiyak ng sistema ng pagsubok ay nasuri sa mga sampol ng DNA na nakuha mula sa 15 species ng fungi. Ang lahat ng mga pilay ng fungi ay nakahiwalay ng mga may-akda mula sa apektado at malusog na prutas at dahon ng kamatis, mga patatas na tubers; ang isang pilay ay ihiwalay mula sa ugat ng trigo (Talahanayan 1). Kabilang sa mga species na nakahiwalay mula sa ibabaw ng prutas, mayroon ding mga species na hindi pathogenic para sa kamatis (halimbawa, Phellinus ferrugineovelutinus).
Ipinakita ng mga pag-aaral na ang C. coccodes DNA ay napansin sa isang threshold cycle ng 20-27, habang ang iba pang mga fungal species ay hindi napansin o nagbigay ng isang senyas pagkatapos ng cycle 40, na maaaring maiugnay sa isang hindi tiyak na ingay na epekto (Talahanayan 3).
Talahanayan 3. Pagsubok sa sistema ng pagsubok para sa iba`t ibang uri ng kabute
Pangalan ng kabute | Cycle ng threshold |
Mga coccode ng Colletotrichum 1 | 20.9 |
C. coccodes 2 | 22.6 |
C. coccodes 3 | 23 |
C. coccodes 4 | 22 |
Fusarium oxysporum | > 40 |
F. verticalillium | > 40 |
Rhizoctonia Solani | > 40 |
Phomopsis phaseoli | > 40 |
Alternaria alternata | > 40 |
A. tomatophila | > 40 |
Helminthosporium solani | > 40 |
Phellinus ferrugineoveltinus | > 40 |
Stemphylium vesicarium | > 40 |
Ilyonectria crassa | > 40 |
Cladosporium cladosporioides | > 40 |
C. fulvum | > 40 |
Acrodontium luzulae | > 40 |
Penicillium sp. | > 40 |
Tandaan * Ang dami ng DNA sa lahat ng mga sample ay 10 ng.
Ang binuo sistema ng pagsubok ay ginamit upang makilala ang mga C. coccode sa mga sample ng dahon ng kamatis na may mga sintomas ng nekrotrophic pathogens at seed potato tubers na walang nakikitang mga sintomas. Para sa pag-aaral, kumuha kami ng mga tubers ng binhi ng iba't ibang mga pagkakaiba-iba na lumago sa mga rehiyon ng Kostroma, Moscow, Kaluga, Nizhny Novgorod. Ang pagkakaroon ng C. coccodes DNA ay itinuturing na makabuluhan sa mga sample, sa pagsusuri kung saan ang cycle ng threshold ay hindi hihigit sa 35. Ang halagang threshold na ito ay pinili batay sa maaasahang pagpapasiya ng 0.05 ng ng C. coccodes DNA (threshold cycle 33.5, Talaan 2) at ang katunayan na sa mga pag-ikot ng threshold sa itaas ng 40, ang hindi tiyak na DNA ng ilang iba pang mga species ng fungi ay nasuri. Sa pamamaraang ito, isang makabuluhang pagkakaroon ng C. coccodes DNA ang napansin sa 5 mga sample ng tubers na lumaki sa mga rehiyon ng Kostroma, Moscow, Kaluga at sa isang dahon ng kamatis mula sa distrito ng Yeisk ng rehiyon ng Krasnodar (Talahanayan 4, 5).
Talahanayan 4. Pagtuklas ng mga coccode ng Colletotrichum sa mga tubers ng patatas *
Sample number | Uri ng patatas | Lugar ng paglago | C. pagtuklas ng coccodes | Cycle ng threshold |
---|---|---|---|---|
1 | Pulang iskarlata | Kostroma rehiyon | + | 35 |
2 | + | 35 | ||
3 | - | 38 | ||
4 | Sante | Moscow region | + | 34 |
5 | - | |||
6 | - | 41 | ||
7 | - | 41.8 | ||
8 | + | 30 | ||
9 | Zhukovsky maaga | Moscow region | - | 40.5 |
10 | - | 40.6 | ||
11 | - | |||
12 | Si Molly | Kaluga rehiyon. | + | 34.3 |
13 | - | 38.4 | ||
14 | Pantasya | Kaluga rehiyon. | - | |
15 | Gala | Nizhny Novgorod rehiyon. | - | |
16 | - |
Tandaan * Ang dami ng DNA sa lahat ng mga sample ay 50 ng.
Talahanayan 5. Pagtuklas ng mga coccode ng Colletotrichum sa mga dahon ng kamatis *
Sample number | Lugar ng paglago | C. pagtuklas ng coccodes | Cycle ng threshold |
---|---|---|---|
1 | Teritoryo ng Krasnodar, Distrito ng Crimean | - | |
2 | - | ||
3 | - | ||
4 | - | 45 | |
5 | - | ||
6 | - | ||
7 | - | ||
8 | - | ||
9 | Rehiyon ng Krasnodar, distrito ng Yeisk | - | 39.2 |
10 | - | 40.8 | |
11 | - | ||
12 | - | 41.6 | |
13 | - | 40 | |
14 | - | 41 | |
15 | - | 41.9 | |
16 | - | ||
17 | - | ||
18 | - | 40.3 | |
19 | - | ||
20 | - | ||
21 | + | 34.5 | |
22 | - | ||
23 | - |
* Ang dami ng DNA sa lahat ng mga sample ay 50 ng.
Ang sistema ng pagsubok na nilikha namin ay hindi mas mababa sa binuo ng mga mananaliksik na British (Cullen et al., 2002) sa pagiging sensitibo at pagiging tiyak at angkop para sa pagsusuri ng mga sample ng halaman. Ang aplikasyon nito para sa pagtatasa ng mga tubers ng binhi ay ginagawang posible upang makilala ang C. coccodes DNA sa tubers nang walang panlabas na palatandaan ng pinsala at upang matagumpay na pag-aralan ang impeksyon ng mga dahon.
Sa ngayon, walang pagtatasa ng mga patatas na tubers para sa infestation ng C. coccodes na natupad sa Russia. Ipinakita ng aming unang pag-aaral na sa 16 nasubok na mga tubers ng binhi na lumaki sa iba't ibang mga rehiyon ng Russian Federation, 5 ang naglalaman ng C. coccodes. Ipinapakita nito na ang itim na lugar ng mga tubers ng patatas ay isang pangkaraniwang sakit na patatas sa Russia, at ang papel nito sa pagbawas ng dami at kalidad ng pananim ng patatas ay minamaliit.
Ang pagtatasa ng mga dahon ng kamatis ay nagsiwalat ng isang makabuluhang pagkakaroon ng C. coccodes DNA sa isang dahon mula sa Yeisk District ng Teritoryo ng Krasnodar. Mas maaga, nang suriin ang mga bukirin ng kamatis sa southern Russia gamit ang British test system (Cullen et al., 2002), natagpuan ang mga dahon na naglalaman ng C. coccodes, at sa ilang larangan ay natagpuan ang isang mataas na proporsyon ng mga dahon na nahawahan ng C. coccodes (Belov et al., 2018). Sa Krasnodar at Primorsky Territories, ang Rehiyon ng Moscow, nakakita kami ng mga prutas na kamatis, kung saan pinamamahalaan namin ang ihiwalay na mga purong kultura ng C. coccodes. Posibleng ang C. coccodes ay higit na kumalat sa kamatis sa Russia kaysa sa pinaniniwalaan ngayon, at ang pagkamahamak nito ay minamaliit din.
Kaya, hanggang ngayon, sapat na impormasyon ang naipon sa malawak na pamamahagi ng C. coccodes sa patatas at kamatis.
Upang higit na maunawaan ang papel na ginagampanan ng halamang-singaw na ito sa pagpapaunlad ng mga sakit na patatas at kamatis, malawak na pagsubaybay sa paglaganap nito sa Russia, pag-aaral ng papel na ginagampanan ng impeksyon sa lupa at binhi, at ang papel na ginagampanan ng itim na lugar sa pagkalugi sa panahon ng pag-iimbak ay kinakailangan. Ang paggamit ng mga diagnostic ng PCR ay maaaring makabuluhang mapadali ang gawaing ito, at ang sabay na paggamit ng parehong mga sistema ng pagsubok ay makabuluhang taasan ang kawastuhan ng pagtatasa.
Ang gawaing ito ay suportado ng bigyan ng Russian Science Foundation blg. 18-76-00009.
Ang artikulo ay nai-publish sa journal na "Mycology and Phytopathology" (dami 54, Blg. 1, 2020).